Atgenomix SeqsLab 通过可扩展的健康组学分析革新精准医疗
realtime news May 19, 2025 21:27
Atgenomix SeqsLab 通过整合 NVIDIA 的 Parabricks 和 Spark-RAPIDS，增强了精准医疗，支持个性化治疗策略的可扩展健康组学分析。
在不断发展的医疗行业中，精准医疗正成为个性化治疗策略的基石。据 NVIDIA 的博客报道，Atgenomix SeqsLab 位于这一变革的核心，是一个尖端平台，旨在利用健康组学的见解来实现精准医疗。
健康组学数据的计算挑战
将电子病历（EMR）与基因组及其他组学数据整合会带来巨大的计算挑战。单个全基因组测序（WGS）数据集可能超过 300 GB，当与蛋白质组学和代谢组学结合时，数据规模可能达到 PB 级。这需要巨大的计算资源和安全的处理以符合 HIPAA 和 GDPR 等法规。
Atgenomix SeqsLab 的高级平台
SeqsLab 通过利用 NVIDIA Parabricks 和 RAPIDS Accelerator for Apache Spark（Spark-RAPIDS）来应对这些挑战。此集成为大规模基因组和电子病历数据的处理加速，让临床医生能够迅速做出明智决定。SeqsLab 的数据湖仓功能支持基因组信息与临床解读的整合，提升了决策过程。
加速基因组分析
Parabricks 通过利用 GPU 加速显著缩短了基因组分析所需的时间。例如，使用 NVIDIA T4 GPU 进行 30x 全基因组测序的变体识别可以在短短 10 分钟内完成，而传统上这项任务使用 CPU 需要数小时。
实现可扩展的数据处理
Spark-RAPIDS 通过加速 SQL 查询和机器学习任务来增强下游分析。训练模型，如癌症类型分类的 XGBoost，在 GPU 加速下快得多，使快速见解和临床应用成为可能。
实现精准医疗工作流程
SeqsLab 自动化整个精准医疗工作流程，从原始测序数据到可操作的见解。平台的可扩展性和合规性解决方案确保了大规模数据的高效处理，支持医院和研究机构推动精准医疗的发展。
通过整合尖端技术，Atgenomix SeqsLab 有望通过更快的诊断、个性化治疗和加速药物发现来改变医疗行业，使精准医疗的最终目标触手可及。
欲了解更多信息，请访问原始 NVIDIA 博客。
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