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Atgenomix SeqsLab 通过可扩展的健康组学分析革新精准医疗 - Blockchain.News

Atgenomix SeqsLab 通过可扩展的健康组学分析革新精准医疗

realtime news May 19, 2025 21:27

Atgenomix SeqsLab 通过整合 NVIDIA 的 Parabricks 和 Spark-RAPIDS,增强了精准医疗,支持个性化治疗策略的可扩展健康组学分析。

Atgenomix SeqsLab 通过可扩展的健康组学分析革新精准医疗

在不断发展的医疗行业中,精准医疗正成为个性化治疗策略的基石。据 NVIDIA 的博客报道,Atgenomix SeqsLab 位于这一变革的核心,是一个尖端平台,旨在利用健康组学的见解来实现精准医疗。

健康组学数据的计算挑战

将电子病历(EMR)与基因组及其他组学数据整合会带来巨大的计算挑战。单个全基因组测序(WGS)数据集可能超过 300 GB,当与蛋白质组学和代谢组学结合时,数据规模可能达到 PB 级。这需要巨大的计算资源和安全的处理以符合 HIPAA 和 GDPR 等法规。

Atgenomix SeqsLab 的高级平台

SeqsLab 通过利用 NVIDIA Parabricks 和 RAPIDS Accelerator for Apache Spark(Spark-RAPIDS)来应对这些挑战。此集成为大规模基因组和电子病历数据的处理加速,让临床医生能够迅速做出明智决定。SeqsLab 的数据湖仓功能支持基因组信息与临床解读的整合,提升了决策过程。

加速基因组分析

Parabricks 通过利用 GPU 加速显著缩短了基因组分析所需的时间。例如,使用 NVIDIA T4 GPU 进行 30x 全基因组测序的变体识别可以在短短 10 分钟内完成,而传统上这项任务使用 CPU 需要数小时。

实现可扩展的数据处理

Spark-RAPIDS 通过加速 SQL 查询和机器学习任务来增强下游分析。训练模型,如癌症类型分类的 XGBoost,在 GPU 加速下快得多,使快速见解和临床应用成为可能。

实现精准医疗工作流程

SeqsLab 自动化整个精准医疗工作流程,从原始测序数据到可操作的见解。平台的可扩展性和合规性解决方案确保了大规模数据的高效处理,支持医院和研究机构推动精准医疗的发展。

通过整合尖端技术,Atgenomix SeqsLab 有望通过更快的诊断、个性化治疗和加速药物发现来改变医疗行业,使精准医疗的最终目标触手可及。

欲了解更多信息,请访问原始 NVIDIA 博客

Image source: Shutterstock