NVIDIA的OpenFold3 NIM：推进生物分子结构预测

NVIDIA的OpenFold3 NIM：推进生物分子结构预测 - Blockchain.News

根据NVIDIA开发者博客，NVIDIA推出了一款创新的AI驱动工具OpenFold3 NIM，旨在变革生物分子结构的预测。这一进步标志着蛋白质组学领域的重大里程碑，在这个领域中，了解氨基酸如何折叠成复杂结构对于科学进步至关重要。

变革性结构预测

由OpenFold Consortium开发并由NVIDIA加速的OpenFold3 NIM，其能力扩展到不仅包括单一蛋白质，还包括多链复合物、核酸和小分子配体。这一发展是更广泛趋势的一部分，深度学习开始解读进化的复杂语言，使结构预测从理论艺术转变为实际的工程学科。

技术进步

集成了NVIDIA的cuEquivariance用于GPU加速，与MMseqs2-GPU兼容进行快速序列搜索，以及NVIDIA FLARE的联邦训练能力，使得OpenFold3能够提供前所未有的性能。该工具现在作为NVIDIA NIM提供额外的加速，使全球的生物制药和生物技术团队都能轻松使用。

实际应用与部署

OpenFold3 NIM简化了快速部署，允许用户高效地从原型转向生产。它支持通过标准REST调用或Python客户端进行交互，提供包括3D坐标和置信度指标的预测。该工具针对NVIDIA H100 Tensor Core GPUs进行了优化，确保快速可靠的结果。

开放科学与企业可靠性

包括Bayer和Johnson & Johnson在内的OpenFold Consortium的重要行业参与者在推进开放、可重复建模系统方面发挥了关键作用。OpenFold3在蛋白质-核酸基准测试中实现了与AlphaFold3的性能平价，展示了其准确性和可靠性。作为开放源代码系统的1级，它确保了透明性和可重复性。

联邦学习与全球合作

OpenFold3通过由Apheris和SandboxAQ验证的安全联邦工作流程，证明了其跨全球研发环境的规模化能力。这使合作伙伴能够在不共享敏感数据集的情况下对模型进行专有数据微调，保持法规合规的同时，通过多样化数据集提高模型性能。

蛋白质AI的未来

OpenFold3不仅仅代表技术进步；它是蛋白质AI未来发展的基础。通过融合开源科学、加速计算和联邦协作，它确保全球研究人员使用的工具符合企业的可靠性和安全标准。

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